本片是完全原创故事，超级英雄们不再是熟悉的样子，超人成为了佐德的儿子，蝙蝠侠成为吸血鬼，神奇女侠是“新神”，正义联盟为了摆脱被诽谤的罪名对科学家遇害事件展开调查。

影片《正义联盟：神与魔》是完全原创故事，正义联盟里的超级英雄们不再是熟悉的样子，超人成为了佐德的儿子，蝙蝠侠成了吸血鬼，神奇女侠是“新神”等等，大使馆陆续发生爆炸，实质是恶势力对抗政府的一种策略，整个城市开始变得躁动不安…

故事讲述了正反两个平行世界间的战斗，在DC宇宙的世界设定中，宇宙里存在无数个平行世界，每个世界都各不相同。其中地球-1就是我们大家熟悉的那些众多超级英雄活跃的世界，而地球-3则是一个和地球-1刚好相反的世界，所有的英雄在地球-3…

本片改编自2003年开始连载的 《超人与蝙蝠侠》漫画系列的第一篇章《全民公敌》，也就是整个系列漫画的第 1-6 集，讲述的是莱克斯卢瑟当上美国总统之后将部分超级英雄收归国有并打算借机铲除死对头超人的故事。最终在超人和蝙蝠侠同心携手…